Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TGFBR1P36897 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TGFBR1P36897 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TGFBR1P36897 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TGFBR1P36897 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TGFBR1P36897 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TGFBR1P36897 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TGFBR1P36897 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TGFBR1P36897 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TGFBR1P36897 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TGFBR1P36897 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TGFBR1P36897 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TGFBR1P36897 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TGFBR1P36897 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TGFBR1P36897 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TGFBR1P36897 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TGFBR1P36897 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TGFBR1P36897 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TGFBR1P36897 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TGFBR1P36897 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TGFBR1P36897 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TGFBR1P36897 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TGFBR1P36897 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TGFBR1P36897 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TGFBR1P36897 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGFBR1P36897 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGFBR1P36897 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TGFBR1P36897 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGFBR1P36897 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGFBR1P36897 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGFBR1P36897 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGFBR1P36897 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGFBR1P36897 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TGFBR1P36897 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TGFBR1P36897 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGFBR1P36897 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TGFBR1P36897 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TGFBR1P36897 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TGFBR1P36897 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TGFBR1P36897 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TGFBR1P36897 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TGFBR1P36897 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TGFBR1P36897 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TGFBR1P36897 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TGFBR1P36897 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TGFBR1P36897 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms