Protein–RNA interactions for Protein: P35408

PTGER4, Prostaglandin E2 receptor EP4 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER4P35408 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTGER4P35408 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PTGER4P35408 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGER4P35408 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms