Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BMI1P35226 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BMI1P35226 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BMI1P35226 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BMI1P35226 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BMI1P35226 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BMI1P35226 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BMI1P35226 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BMI1P35226 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BMI1P35226 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BMI1P35226 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BMI1P35226 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BMI1P35226 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BMI1P35226 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BMI1P35226 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BMI1P35226 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BMI1P35226 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BMI1P35226 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BMI1P35226 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BMI1P35226 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BMI1P35226 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BMI1P35226 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BMI1P35226 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BMI1P35226 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BMI1P35226 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BMI1P35226 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BMI1P35226 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BMI1P35226 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BMI1P35226 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BMI1P35226 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BMI1P35226 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BMI1P35226 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BMI1P35226 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BMI1P35226 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BMI1P35226 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BMI1P35226 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BMI1P35226 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BMI1P35226 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BMI1P35226 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BMI1P35226 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BMI1P35226 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BMI1P35226 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BMI1P35226 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BMI1P35226 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BMI1P35226 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BMI1P35226 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BMI1P35226 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BMI1P35226 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BMI1P35226 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BMI1P35226 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BMI1P35226 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BMI1P35226 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BMI1P35226 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BMI1P35226 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BMI1P35226 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BMI1P35226 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BMI1P35226 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BMI1P35226 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BMI1P35226 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BMI1P35226 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BMI1P35226 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMI1P35226 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMI1P35226 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMI1P35226 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMI1P35226 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMI1P35226 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMI1P35226 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMI1P35226 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMI1P35226 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BMI1P35226 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BMI1P35226 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BMI1P35226 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BMI1P35226 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BMI1P35226 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BMI1P35226 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BMI1P35226 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BMI1P35226 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BMI1P35226 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BMI1P35226 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BMI1P35226 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMI1P35226 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMI1P35226 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMI1P35226 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMI1P35226 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMI1P35226 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMI1P35226 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMI1P35226 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMI1P35226 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMI1P35226 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMI1P35226 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMI1P35226 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMI1P35226 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BMI1P35226 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BMI1P35226 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMI1P35226 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMI1P35226 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMI1P35226 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMI1P35226 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMI1P35226 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMI1P35226 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms