Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GBP1P32455 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GBP1P32455 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GBP1P32455 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GBP1P32455 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GBP1P32455 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GBP1P32455 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GBP1P32455 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GBP1P32455 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GBP1P32455 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GBP1P32455 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GBP1P32455 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GBP1P32455 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GBP1P32455 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GBP1P32455 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GBP1P32455 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GBP1P32455 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GBP1P32455 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GBP1P32455 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GBP1P32455 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBP1P32455 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBP1P32455 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBP1P32455 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBP1P32455 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBP1P32455 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBP1P32455 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBP1P32455 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBP1P32455 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBP1P32455 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBP1P32455 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBP1P32455 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBP1P32455 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBP1P32455 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBP1P32455 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GBP1P32455 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GBP1P32455 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GBP1P32455 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GBP1P32455 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GBP1P32455 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GBP1P32455 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GBP1P32455 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GBP1P32455 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GBP1P32455 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GBP1P32455 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GBP1P32455 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GBP1P32455 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GBP1P32455 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GBP1P32455 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GBP1P32455 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GBP1P32455 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GBP1P32455 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GBP1P32455 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GBP1P32455 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GBP1P32455 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GBP1P32455 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GBP1P32455 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GBP1P32455 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GBP1P32455 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GBP1P32455 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GBP1P32455 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GBP1P32455 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GBP1P32455 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GBP1P32455 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GBP1P32455 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GBP1P32455 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GBP1P32455 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GBP1P32455 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GBP1P32455 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GBP1P32455 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GBP1P32455 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GBP1P32455 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GBP1P32455 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GBP1P32455 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GBP1P32455 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GBP1P32455 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GBP1P32455 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GBP1P32455 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBP1P32455 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBP1P32455 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBP1P32455 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBP1P32455 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBP1P32455 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBP1P32455 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBP1P32455 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBP1P32455 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBP1P32455 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBP1P32455 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBP1P32455 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBP1P32455 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBP1P32455 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GBP1P32455 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GBP1P32455 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GBP1P32455 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GBP1P32455 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GBP1P32455 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GBP1P32455 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GBP1P32455 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GBP1P32455 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBP1P32455 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBP1P32455 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms