Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CPS1P31327 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
CPS1P31327 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CPS1P31327 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CPS1P31327 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CPS1P31327 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CPS1P31327 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
CPS1P31327 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CPS1P31327 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CPS1P31327 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CPS1P31327 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CPS1P31327 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CPS1P31327 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CPS1P31327 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
CPS1P31327 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
CPS1P31327 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
CPS1P31327 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CPS1P31327 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CPS1P31327 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CPS1P31327 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CPS1P31327 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CPS1P31327 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CPS1P31327 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CPS1P31327 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CPS1P31327 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CPS1P31327 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CPS1P31327 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CPS1P31327 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CPS1P31327 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CPS1P31327 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CPS1P31327 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CPS1P31327 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CPS1P31327 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CPS1P31327 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CPS1P31327 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CPS1P31327 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CPS1P31327 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CPS1P31327 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CPS1P31327 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
CPS1P31327 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
CPS1P31327 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
CPS1P31327 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
CPS1P31327 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
CPS1P31327 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CPS1P31327 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CPS1P31327 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CPS1P31327 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CPS1P31327 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CPS1P31327 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CPS1P31327 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CPS1P31327 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CPS1P31327 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CPS1P31327 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CPS1P31327 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CPS1P31327 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CPS1P31327 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CPS1P31327 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CPS1P31327 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CPS1P31327 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CPS1P31327 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CPS1P31327 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CPS1P31327 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CPS1P31327 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CPS1P31327 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CPS1P31327 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
CPS1P31327 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CPS1P31327 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
CPS1P31327 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CPS1P31327 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CPS1P31327 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CPS1P31327 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CPS1P31327 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CPS1P31327 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CPS1P31327 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CPS1P31327 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CPS1P31327 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CPS1P31327 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CPS1P31327 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
CPS1P31327 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CPS1P31327 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
CPS1P31327 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CPS1P31327 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CPS1P31327 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CPS1P31327 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CPS1P31327 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CPS1P31327 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CPS1P31327 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CPS1P31327 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
CPS1P31327 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CPS1P31327 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CPS1P31327 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CPS1P31327 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CPS1P31327 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CPS1P31327 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CPS1P31327 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
CPS1P31327 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CPS1P31327 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CPS1P31327 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
CPS1P31327 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CPS1P31327 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms