Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA11P31270 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA11P31270 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA11P31270 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA11P31270 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA11P31270 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA11P31270 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA11P31270 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA11P31270 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA11P31270 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA11P31270 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA11P31270 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA11P31270 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA11P31270 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA11P31270 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA11P31270 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA11P31270 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA11P31270 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA11P31270 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA11P31270 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA11P31270 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA11P31270 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA11P31270 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA11P31270 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA11P31270 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA11P31270 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA11P31270 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA11P31270 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA11P31270 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXA11P31270 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXA11P31270 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXA11P31270 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXA11P31270 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXA11P31270 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXA11P31270 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXA11P31270 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXA11P31270 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXA11P31270 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXA11P31270 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXA11P31270 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXA11P31270 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXA11P31270 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXA11P31270 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXA11P31270 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA11P31270 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA11P31270 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA11P31270 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA11P31270 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA11P31270 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA11P31270 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA11P31270 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXA11P31270 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXA11P31270 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXA11P31270 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXA11P31270 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXA11P31270 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXA11P31270 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXA11P31270 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXA11P31270 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXA11P31270 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXA11P31270 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXA11P31270 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXA11P31270 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXA11P31270 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HOXA11P31270 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXA11P31270 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXA11P31270 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXA11P31270 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXA11P31270 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXA11P31270 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXA11P31270 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXA11P31270 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXA11P31270 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXA11P31270 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXA11P31270 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXA11P31270 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXA11P31270 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXA11P31270 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXA11P31270 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXA11P31270 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXA11P31270 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXA11P31270 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXA11P31270 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXA11P31270 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXA11P31270 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXA11P31270 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXA11P31270 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXA11P31270 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXA11P31270 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXA11P31270 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXA11P31270 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXA11P31270 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXA11P31270 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXA11P31270 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXA11P31270 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXA11P31270 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXA11P31270 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXA11P31270 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXA11P31270 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXA11P31270 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms