Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CLIP1P30622 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC38.59■■■■□ 3.77
CLIP1P30622 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CLIP1P30622 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CLIP1P30622 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CLIP1P30622 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CLIP1P30622 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CLIP1P30622 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
CLIP1P30622 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
CLIP1P30622 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
CLIP1P30622 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
CLIP1P30622 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CLIP1P30622 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CLIP1P30622 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CLIP1P30622 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
CLIP1P30622 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CLIP1P30622 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CLIP1P30622 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CLIP1P30622 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CLIP1P30622 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CLIP1P30622 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CLIP1P30622 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
CLIP1P30622 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CLIP1P30622 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CLIP1P30622 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CLIP1P30622 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CLIP1P30622 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CLIP1P30622 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CLIP1P30622 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CLIP1P30622 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CLIP1P30622 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CLIP1P30622 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
CLIP1P30622 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CLIP1P30622 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CLIP1P30622 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CLIP1P30622 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
CLIP1P30622 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CLIP1P30622 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CLIP1P30622 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CLIP1P30622 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CLIP1P30622 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
CLIP1P30622 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CLIP1P30622 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CLIP1P30622 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
CLIP1P30622 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CLIP1P30622 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CLIP1P30622 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CLIP1P30622 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CLIP1P30622 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CLIP1P30622 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CLIP1P30622 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CLIP1P30622 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CLIP1P30622 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CLIP1P30622 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CLIP1P30622 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CLIP1P30622 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CLIP1P30622 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CLIP1P30622 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
CLIP1P30622 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CLIP1P30622 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CLIP1P30622 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CLIP1P30622 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CLIP1P30622 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CLIP1P30622 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CLIP1P30622 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CLIP1P30622 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CLIP1P30622 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CLIP1P30622 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CLIP1P30622 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CLIP1P30622 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CLIP1P30622 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CLIP1P30622 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CLIP1P30622 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
CLIP1P30622 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CLIP1P30622 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CLIP1P30622 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CLIP1P30622 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CLIP1P30622 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
CLIP1P30622 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CLIP1P30622 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CLIP1P30622 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CLIP1P30622 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CLIP1P30622 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CLIP1P30622 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CLIP1P30622 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CLIP1P30622 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CLIP1P30622 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CLIP1P30622 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
CLIP1P30622 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CLIP1P30622 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CLIP1P30622 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CLIP1P30622 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CLIP1P30622 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CLIP1P30622 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CLIP1P30622 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
CLIP1P30622 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC38.38■■■■□ 3.74
CLIP1P30622 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CLIP1P30622 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CLIP1P30622 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CLIP1P30622 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms