Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNGA1P29973 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CNGA1P29973 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CNGA1P29973 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CNGA1P29973 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CNGA1P29973 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CNGA1P29973 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CNGA1P29973 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CNGA1P29973 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CNGA1P29973 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CNGA1P29973 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNGA1P29973 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNGA1P29973 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNGA1P29973 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNGA1P29973 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNGA1P29973 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNGA1P29973 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNGA1P29973 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNGA1P29973 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNGA1P29973 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNGA1P29973 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNGA1P29973 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNGA1P29973 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNGA1P29973 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNGA1P29973 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNGA1P29973 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNGA1P29973 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNGA1P29973 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNGA1P29973 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNGA1P29973 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNGA1P29973 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CNGA1P29973 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNGA1P29973 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNGA1P29973 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNGA1P29973 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNGA1P29973 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNGA1P29973 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNGA1P29973 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNGA1P29973 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNGA1P29973 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNGA1P29973 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CNGA1P29973 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CNGA1P29973 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CNGA1P29973 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CNGA1P29973 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CNGA1P29973 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNGA1P29973 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNGA1P29973 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNGA1P29973 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNGA1P29973 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNGA1P29973 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CNGA1P29973 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CNGA1P29973 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNGA1P29973 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNGA1P29973 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNGA1P29973 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNGA1P29973 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNGA1P29973 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNGA1P29973 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNGA1P29973 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNGA1P29973 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNGA1P29973 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNGA1P29973 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNGA1P29973 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNGA1P29973 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNGA1P29973 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNGA1P29973 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNGA1P29973 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNGA1P29973 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNGA1P29973 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNGA1P29973 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNGA1P29973 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNGA1P29973 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNGA1P29973 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNGA1P29973 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNGA1P29973 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CNGA1P29973 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNGA1P29973 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNGA1P29973 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNGA1P29973 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNGA1P29973 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNGA1P29973 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNGA1P29973 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNGA1P29973 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CNGA1P29973 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CNGA1P29973 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNGA1P29973 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNGA1P29973 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNGA1P29973 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNGA1P29973 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNGA1P29973 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNGA1P29973 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNGA1P29973 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNGA1P29973 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNGA1P29973 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNGA1P29973 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNGA1P29973 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNGA1P29973 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNGA1P29973 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CNGA1P29973 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms