Protein–RNA interactions for Protein: P28476

GABRR2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-2, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR2P28476 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GABRR2P28476 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GABRR2P28476 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABRR2P28476 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABRR2P28476 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABRR2P28476 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABRR2P28476 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABRR2P28476 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABRR2P28476 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABRR2P28476 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABRR2P28476 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABRR2P28476 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GABRR2P28476 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GABRR2P28476 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GABRR2P28476 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GABRR2P28476 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GABRR2P28476 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GABRR2P28476 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GABRR2P28476 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GABRR2P28476 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GABRR2P28476 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GABRR2P28476 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GABRR2P28476 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GABRR2P28476 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABRR2P28476 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABRR2P28476 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GABRR2P28476 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GABRR2P28476 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABRR2P28476 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABRR2P28476 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABRR2P28476 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABRR2P28476 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABRR2P28476 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABRR2P28476 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABRR2P28476 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABRR2P28476 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABRR2P28476 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABRR2P28476 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GABRR2P28476 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GABRR2P28476 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GABRR2P28476 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GABRR2P28476 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRR2P28476 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRR2P28476 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRR2P28476 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRR2P28476 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRR2P28476 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABRR2P28476 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABRR2P28476 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GABRR2P28476 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABRR2P28476 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABRR2P28476 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABRR2P28476 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABRR2P28476 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABRR2P28476 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABRR2P28476 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABRR2P28476 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GABRR2P28476 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABRR2P28476 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABRR2P28476 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABRR2P28476 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABRR2P28476 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABRR2P28476 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABRR2P28476 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABRR2P28476 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABRR2P28476 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABRR2P28476 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABRR2P28476 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABRR2P28476 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABRR2P28476 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABRR2P28476 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABRR2P28476 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABRR2P28476 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GABRR2P28476 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GABRR2P28476 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GABRR2P28476 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GABRR2P28476 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GABRR2P28476 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GABRR2P28476 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GABRR2P28476 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GABRR2P28476 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GABRR2P28476 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GABRR2P28476 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GABRR2P28476 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GABRR2P28476 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GABRR2P28476 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GABRR2P28476 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GABRR2P28476 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GABRR2P28476 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GABRR2P28476 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GABRR2P28476 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GABRR2P28476 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GABRR2P28476 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GABRR2P28476 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABRR2P28476 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABRR2P28476 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABRR2P28476 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABRR2P28476 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABRR2P28476 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GABRR2P28476 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms