Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTAFRP25105 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTAFRP25105 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTAFRP25105 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTAFRP25105 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTAFRP25105 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTAFRP25105 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTAFRP25105 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTAFRP25105 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PTAFRP25105 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTAFRP25105 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTAFRP25105 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTAFRP25105 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTAFRP25105 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTAFRP25105 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTAFRP25105 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTAFRP25105 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTAFRP25105 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTAFRP25105 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTAFRP25105 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTAFRP25105 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTAFRP25105 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTAFRP25105 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTAFRP25105 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTAFRP25105 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTAFRP25105 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTAFRP25105 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTAFRP25105 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTAFRP25105 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTAFRP25105 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTAFRP25105 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTAFRP25105 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTAFRP25105 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTAFRP25105 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTAFRP25105 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTAFRP25105 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTAFRP25105 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTAFRP25105 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTAFRP25105 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms