Protein–RNA interactions for Protein: P23415

GLRA1, Glycine receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLRA1P23415 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GLRA1P23415 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLRA1P23415 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLRA1P23415 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLRA1P23415 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLRA1P23415 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLRA1P23415 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLRA1P23415 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLRA1P23415 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLRA1P23415 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLRA1P23415 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLRA1P23415 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLRA1P23415 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GLRA1P23415 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLRA1P23415 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLRA1P23415 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLRA1P23415 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GLRA1P23415 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLRA1P23415 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLRA1P23415 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLRA1P23415 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLRA1P23415 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLRA1P23415 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GLRA1P23415 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GLRA1P23415 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GLRA1P23415 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GLRA1P23415 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GLRA1P23415 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GLRA1P23415 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GLRA1P23415 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GLRA1P23415 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GLRA1P23415 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GLRA1P23415 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLRA1P23415 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLRA1P23415 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLRA1P23415 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLRA1P23415 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLRA1P23415 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLRA1P23415 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLRA1P23415 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLRA1P23415 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLRA1P23415 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLRA1P23415 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GLRA1P23415 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GLRA1P23415 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GLRA1P23415 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GLRA1P23415 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GLRA1P23415 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GLRA1P23415 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GLRA1P23415 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GLRA1P23415 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GLRA1P23415 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GLRA1P23415 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GLRA1P23415 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GLRA1P23415 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GLRA1P23415 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GLRA1P23415 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GLRA1P23415 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms