Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.234e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 PSPH-210ENST00000437355 1409 ntTSL 513.57□□□□□ -0.242e-10■■■■■ 40.4
RPS3P23396 RNF167-204ENST00000571365 535 ntTSL 213.41□□□□□ -0.261e-11■■■■■ 40.4
RPS3P23396 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.284e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 RNF167-215ENST00000576452 589 ntTSL 513.28□□□□□ -0.281e-11■■■■■ 40.4
RPS3P23396 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.294e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.324e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 EXOSC1-209ENST00000477692 480 ntTSL 512.98□□□□□ -0.334e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 TXNL1-205ENST00000587613 934 ntTSL 312.98□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 UBE2A-210ENST00000630695 1771 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.348e-8■■■■■ 40.4
RPS3P23396 WDR6-217ENST00000491365 491 ntTSL 312.73□□□□□ -0.374e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 WDR6-215ENST00000489427 564 ntTSL 412.59□□□□□ -0.394e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.424e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 PPP5C-208ENST00000491003 878 ntTSL 312.25□□□□□ -0.454e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 RNF167-207ENST00000572430 1511 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.481e-11■■■■■ 40.4
RPS3P23396 UBE2A-211ENST00000631185 1435 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.488e-8■■■■■ 40.4
RPS3P23396 AD000671.1-201ENST00000591613 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.483e-11■■■■■ 40.4
RPS3P23396 GMNN-207ENST00000620958 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.494e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 MRPS22-214ENST00000498505 1401 ntTSL 1 (best)12.02□□□□□ -0.494e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 MRPS22-204ENST00000466690 827 ntTSL 511.95□□□□□ -0.54e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 RAD50-209ENST00000533482 4373 ntTSL 1 (best)11.89□□□□□ -0.514e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 NBR1-205ENST00000589872 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.514e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 GMNN-202ENST00000356509 1133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 PRKN-206ENST00000366898 4180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.534e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 NBR1-202ENST00000542611 2703 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.544e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 AC116366.3-201ENST00000638452 7893 ntAPPRIS ALT2 TSL 511.59□□□□□ -0.554e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 DBI-204ENST00000409094 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.563e-10■■■■■ 40.4
RPS3P23396 MRPS22-207ENST00000480938 1774 ntTSL 211.42□□□□□ -0.584e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 MRPS22-202ENST00000465056 1099 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.594e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 KBTBD4-209ENST00000533290 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.624e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 DBI-202ENST00000355857 637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.623e-10■■■■■ 40.4
RPS3P23396 RNF167-209ENST00000573404 552 ntTSL 411.18□□□□□ -0.621e-11■■■■■ 40.4
RPS3P23396 DBI-209ENST00000535757 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.633e-10■■■■■ 40.4
RPS3P23396 RNF167-202ENST00000570328 298 ntTSL 311.08□□□□□ -0.641e-11■■■■■ 40.4
RPS3P23396 CD3D-201ENST00000300692 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.644e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 EXOSC1-207ENST00000474309 260 ntTSL 510.95□□□□□ -0.664e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 RAD50-201ENST00000378823 8306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.674e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 WDR6-203ENST00000419837 538 ntTSL 410.74□□□□□ -0.694e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 PPP5C-209ENST00000492109 848 ntTSL 210.72□□□□□ -0.694e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 COPG2-202ENST00000425248 3134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.74e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 EXOSC1-202ENST00000370885 718 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.724e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 EXOSC1-208ENST00000476234 739 ntTSL 210.58□□□□□ -0.724e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 MRPS22-203ENST00000465373 600 ntTSL 310.55□□□□□ -0.724e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 UBA1-207ENST00000451702 1706 ntTSL 510.51□□□□□ -0.737e-8■■■■■ 40.4
RPS3P23396 TXNL1-201ENST00000217515 6894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.732e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 EXOSC1-201ENST00000370884 536 ntTSL 510.49□□□□□ -0.734e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 EXOSC1-204ENST00000370902 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.734e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 EXOSC1-206ENST00000472345 451 ntTSL 310.49□□□□□ -0.734e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 VAPB-204ENST00000475243 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.734e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 EXOSC1-203ENST00000370886 741 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.734e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 UBE2A-201ENST00000346330 718 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.748e-8■■■■■ 40.4
RPS3P23396 NBR1-206ENST00000590996 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.744e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 GUCY1A2-203ENST00000526355 16205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.754e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 MYO5A-205ENST00000399231 12225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.794e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 DBI-206ENST00000475783 842 ntTSL 1 (best)10.1□□□□□ -0.791e-9■■■■■ 40.4
RPS3P23396 PSENEN-201ENST00000222266 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.83e-11■■■■■ 40.4
RPS3P23396 MYO5A-213ENST00000613858 12139 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.814e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 MYO5A-206ENST00000399233 12220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.814e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 MYO5A-202ENST00000358212 12220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.814e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 ALDH2-201ENST00000261733 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.821e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 CD3D-204ENST00000529594 422 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.824e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 DBI-208ENST00000535617 654 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.833e-10■■■■■ 40.4
RPS3P23396 PSPH-211ENST00000459834 692 ntTSL 39.72□□□□□ -0.852e-10■■■■■ 40.4
RPS3P23396 KBTBD4-201ENST00000395288 2460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.924e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 GTF2B-207ENST00000494819 893 ntTSL 59.26□□□□□ -0.934e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 GTF2B-201ENST00000370500 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.944e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 KBTBD4-204ENST00000526005 2444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.984e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 DECR1-216ENST00000522583 651 ntTSL 38.91□□□□□ -0.984e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 EXOSC1-210ENST00000485122 564 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.014e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 EXOSC1-211ENST00000489158 2113 ntTSL 28.73□□□□□ -1.014e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 VAPB-201ENST00000265619 3596 ntTSL 28.57□□□□□ -1.044e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 VPS13D-212ENST00000543766 3838 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.054e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 VAPB-206ENST00000520497 937 ntTSL 28.46□□□□□ -1.064e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 MAGEC1-201ENST00000285879 4270 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.084e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 EXOSC1-205ENST00000471049 642 ntTSL 58.2□□□□□ -1.14e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 NBR1-201ENST00000341165 4656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.154e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 AC116366.3-203ENST00000639899 8173 ntTSL 57.73□□□□□ -1.174e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 COPG2-203ENST00000617523 2142 ntTSL 57.71□□□□□ -1.184e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 VPS13D-211ENST00000543710 5676 ntTSL 1 (best)7.57□□□□□ -1.24e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 KIF11-201ENST00000260731 4860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.254e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.254e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 TXNL1-204ENST00000586262 3541 ntTSL 1 (best)6.77□□□□□ -1.322e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.334e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 AC116366.3-202ENST00000638568 7956 ntAPPRIS ALT2 TSL 56.63□□□□□ -1.354e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 NAA20-205ENST00000480550 1000 ntTSL 56.45□□□□□ -1.384e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 RAD50-206ENST00000455677 564 ntTSL 56.43□□□□□ -1.384e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 AC116366.3-204ENST00000638504 7262 ntAPPRIS P5 TSL 56.35□□□□□ -1.394e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 GTF2B-202ENST00000418217 783 ntTSL 56.31□□□□□ -1.44e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 NAA20-204ENST00000463154 1036 ntTSL 36.26□□□□□ -1.414e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.434e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 MIS18A-202ENST00000486363 368 ntTSL 35.8□□□□□ -1.484e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 VPS13D-201ENST00000011700 10969 ntTSL 1 (best)5.79□□□□□ -1.484e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 CHD4-206ENST00000536999 318 ntTSL 35.67□□□□□ -1.54e-7■■■■■ 40.4
RPS3P23396 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.544e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 UBAP2L-218ENST00000493867 677 ntTSL 35.32□□□□□ -1.564e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 MATR3-211ENST00000505625 7306 ntTSL 1 (best)5.17□□□□□ -1.584e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.64e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.614e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 GTF2B-203ENST00000448623 770 ntTSL 54.96□□□□□ -1.624e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 SNAP23-211ENST00000566035 846 ntTSL 34.86□□□□□ -1.634e-6■■■■■ 40.4
Retrieved 100 of 24,271 protein–RNA pairs in 216.2 ms