Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME2P23368 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME2P23368 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME2P23368 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME2P23368 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME2P23368 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME2P23368 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME2P23368 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME2P23368 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME2P23368 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME2P23368 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME2P23368 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ME2P23368 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME2P23368 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME2P23368 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME2P23368 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME2P23368 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME2P23368 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME2P23368 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME2P23368 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME2P23368 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME2P23368 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME2P23368 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ME2P23368 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ME2P23368 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ME2P23368 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ME2P23368 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
ME2P23368 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME2P23368 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME2P23368 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME2P23368 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ME2P23368 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME2P23368 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME2P23368 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ME2P23368 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ME2P23368 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ME2P23368 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ME2P23368 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
ME2P23368 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ME2P23368 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ME2P23368 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ME2P23368 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ME2P23368 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ME2P23368 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ME2P23368 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME2P23368 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME2P23368 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME2P23368 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME2P23368 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME2P23368 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME2P23368 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ME2P23368 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME2P23368 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME2P23368 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME2P23368 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME2P23368 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME2P23368 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME2P23368 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME2P23368 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME2P23368 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME2P23368 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ME2P23368 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ME2P23368 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ME2P23368 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ME2P23368 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ME2P23368 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ME2P23368 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ME2P23368 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ME2P23368 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ME2P23368 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ME2P23368 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ME2P23368 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ME2P23368 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ME2P23368 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ME2P23368 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ME2P23368 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ME2P23368 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ME2P23368 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ME2P23368 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ME2P23368 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ME2P23368 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ME2P23368 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ME2P23368 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ME2P23368 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ME2P23368 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ME2P23368 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ME2P23368 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ME2P23368 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ME2P23368 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ME2P23368 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ME2P23368 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ME2P23368 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ME2P23368 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ME2P23368 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ME2P23368 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ME2P23368 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ME2P23368 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME2P23368 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME2P23368 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME2P23368 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms