Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C4BPBP20851 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C4BPBP20851 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C4BPBP20851 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C4BPBP20851 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C4BPBP20851 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
C4BPBP20851 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C4BPBP20851 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C4BPBP20851 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C4BPBP20851 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C4BPBP20851 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C4BPBP20851 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
C4BPBP20851 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C4BPBP20851 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C4BPBP20851 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C4BPBP20851 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C4BPBP20851 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4BPBP20851 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4BPBP20851 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4BPBP20851 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4BPBP20851 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4BPBP20851 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4BPBP20851 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
C4BPBP20851 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4BPBP20851 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4BPBP20851 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4BPBP20851 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
C4BPBP20851 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
C4BPBP20851 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
C4BPBP20851 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms