Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCG2P13521 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCG2P13521 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCG2P13521 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCG2P13521 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCG2P13521 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCG2P13521 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCG2P13521 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCG2P13521 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCG2P13521 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCG2P13521 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SCG2P13521 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCG2P13521 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCG2P13521 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCG2P13521 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCG2P13521 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCG2P13521 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCG2P13521 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCG2P13521 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCG2P13521 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCG2P13521 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCG2P13521 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCG2P13521 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCG2P13521 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCG2P13521 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCG2P13521 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCG2P13521 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SCG2P13521 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCG2P13521 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCG2P13521 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCG2P13521 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCG2P13521 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCG2P13521 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SCG2P13521 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCG2P13521 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCG2P13521 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCG2P13521 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCG2P13521 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCG2P13521 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCG2P13521 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCG2P13521 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCG2P13521 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SCG2P13521 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCG2P13521 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCG2P13521 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCG2P13521 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCG2P13521 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SCG2P13521 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SCG2P13521 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SCG2P13521 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCG2P13521 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCG2P13521 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCG2P13521 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCG2P13521 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCG2P13521 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCG2P13521 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCG2P13521 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCG2P13521 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SCG2P13521 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCG2P13521 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCG2P13521 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCG2P13521 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCG2P13521 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCG2P13521 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCG2P13521 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCG2P13521 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCG2P13521 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SCG2P13521 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SCG2P13521 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCG2P13521 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCG2P13521 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCG2P13521 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCG2P13521 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCG2P13521 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCG2P13521 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCG2P13521 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCG2P13521 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCG2P13521 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCG2P13521 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCG2P13521 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCG2P13521 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCG2P13521 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCG2P13521 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCG2P13521 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SCG2P13521 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCG2P13521 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCG2P13521 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCG2P13521 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCG2P13521 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCG2P13521 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCG2P13521 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCG2P13521 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCG2P13521 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCG2P13521 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCG2P13521 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCG2P13521 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCG2P13521 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCG2P13521 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SCG2P13521 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCG2P13521 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms