Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CKBP12277 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CKBP12277 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CKBP12277 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CKBP12277 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CKBP12277 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CKBP12277 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CKBP12277 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CKBP12277 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CKBP12277 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CKBP12277 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CKBP12277 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CKBP12277 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CKBP12277 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CKBP12277 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CKBP12277 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CKBP12277 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CKBP12277 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CKBP12277 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CKBP12277 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CKBP12277 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CKBP12277 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CKBP12277 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CKBP12277 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CKBP12277 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CKBP12277 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CKBP12277 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CKBP12277 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CKBP12277 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CKBP12277 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CKBP12277 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CKBP12277 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CKBP12277 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CKBP12277 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CKBP12277 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CKBP12277 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CKBP12277 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CKBP12277 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CKBP12277 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CKBP12277 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CKBP12277 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CKBP12277 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CKBP12277 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CKBP12277 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CKBP12277 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CKBP12277 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CKBP12277 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CKBP12277 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CKBP12277 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CKBP12277 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CKBP12277 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CKBP12277 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CKBP12277 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CKBP12277 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CKBP12277 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CKBP12277 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CKBP12277 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CKBP12277 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CKBP12277 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CKBP12277 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CKBP12277 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CKBP12277 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CKBP12277 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CKBP12277 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CKBP12277 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CKBP12277 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CKBP12277 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CKBP12277 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CKBP12277 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CKBP12277 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CKBP12277 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CKBP12277 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CKBP12277 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CKBP12277 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CKBP12277 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CKBP12277 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CKBP12277 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CKBP12277 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CKBP12277 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CKBP12277 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CKBP12277 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CKBP12277 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CKBP12277 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CKBP12277 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CKBP12277 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CKBP12277 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CKBP12277 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CKBP12277 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CKBP12277 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CKBP12277 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CKBP12277 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CKBP12277 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CKBP12277 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CKBP12277 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CKBP12277 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CKBP12277 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CKBP12277 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CKBP12277 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CKBP12277 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CKBP12277 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms