Protein–RNA interactions for Protein: P10398

ARAF, Serine/threonine-protein kinase A-Raf, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAFP10398 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARAFP10398 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARAFP10398 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARAFP10398 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARAFP10398 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARAFP10398 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARAFP10398 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARAFP10398 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARAFP10398 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARAFP10398 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARAFP10398 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARAFP10398 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARAFP10398 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARAFP10398 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARAFP10398 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARAFP10398 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARAFP10398 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARAFP10398 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARAFP10398 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARAFP10398 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARAFP10398 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARAFP10398 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARAFP10398 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARAFP10398 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARAFP10398 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARAFP10398 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARAFP10398 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARAFP10398 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARAFP10398 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARAFP10398 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARAFP10398 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARAFP10398 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARAFP10398 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARAFP10398 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARAFP10398 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARAFP10398 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARAFP10398 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARAFP10398 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARAFP10398 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARAFP10398 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARAFP10398 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARAFP10398 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARAFP10398 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARAFP10398 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARAFP10398 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARAFP10398 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARAFP10398 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARAFP10398 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARAFP10398 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARAFP10398 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARAFP10398 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARAFP10398 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARAFP10398 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARAFP10398 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARAFP10398 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARAFP10398 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARAFP10398 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARAFP10398 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARAFP10398 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARAFP10398 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARAFP10398 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARAFP10398 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARAFP10398 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARAFP10398 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARAFP10398 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARAFP10398 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARAFP10398 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARAFP10398 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARAFP10398 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARAFP10398 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARAFP10398 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARAFP10398 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ARAFP10398 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARAFP10398 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARAFP10398 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARAFP10398 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARAFP10398 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARAFP10398 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARAFP10398 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARAFP10398 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARAFP10398 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARAFP10398 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARAFP10398 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARAFP10398 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARAFP10398 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARAFP10398 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARAFP10398 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARAFP10398 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARAFP10398 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARAFP10398 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARAFP10398 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARAFP10398 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARAFP10398 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARAFP10398 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARAFP10398 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARAFP10398 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARAFP10398 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARAFP10398 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARAFP10398 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARAFP10398 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms