Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL3P10147 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL3P10147 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL3P10147 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL3P10147 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL3P10147 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL3P10147 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL3P10147 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL3P10147 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL3P10147 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL3P10147 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL3P10147 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL3P10147 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL3P10147 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL3P10147 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL3P10147 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL3P10147 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL3P10147 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL3P10147 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL3P10147 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL3P10147 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL3P10147 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL3P10147 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL3P10147 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL3P10147 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL3P10147 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL3P10147 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL3P10147 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCL3P10147 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCL3P10147 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCL3P10147 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCL3P10147 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCL3P10147 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCL3P10147 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCL3P10147 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL3P10147 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL3P10147 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL3P10147 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL3P10147 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL3P10147 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL3P10147 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL3P10147 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCL3P10147 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCL3P10147 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCL3P10147 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCL3P10147 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCL3P10147 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL3P10147 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL3P10147 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL3P10147 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL3P10147 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL3P10147 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCL3P10147 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL3P10147 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL3P10147 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL3P10147 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL3P10147 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL3P10147 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL3P10147 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL3P10147 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL3P10147 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL3P10147 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL3P10147 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL3P10147 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL3P10147 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL3P10147 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL3P10147 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL3P10147 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL3P10147 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL3P10147 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCL3P10147 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCL3P10147 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCL3P10147 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCL3P10147 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCL3P10147 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCL3P10147 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCL3P10147 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCL3P10147 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCL3P10147 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCL3P10147 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCL3P10147 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCL3P10147 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCL3P10147 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCL3P10147 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCL3P10147 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCL3P10147 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCL3P10147 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCL3P10147 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCL3P10147 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCL3P10147 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCL3P10147 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCL3P10147 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCL3P10147 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCL3P10147 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCL3P10147 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCL3P10147 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCL3P10147 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCL3P10147 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCL3P10147 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCL3P10147 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.2 ms