Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SRGAP2CP0DJJ0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SRGAP2CP0DJJ0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SRGAP2CP0DJJ0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SRGAP2CP0DJJ0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRGAP2CP0DJJ0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRGAP2CP0DJJ0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRGAP2CP0DJJ0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRGAP2CP0DJJ0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SRGAP2CP0DJJ0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRGAP2CP0DJJ0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRGAP2CP0DJJ0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRGAP2CP0DJJ0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRGAP2CP0DJJ0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRGAP2CP0DJJ0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRGAP2CP0DJJ0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRGAP2CP0DJJ0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRGAP2CP0DJJ0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRGAP2CP0DJJ0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRGAP2CP0DJJ0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRGAP2CP0DJJ0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRGAP2CP0DJJ0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRGAP2CP0DJJ0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRGAP2CP0DJJ0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRGAP2CP0DJJ0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRGAP2CP0DJJ0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRGAP2CP0DJJ0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRGAP2CP0DJJ0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRGAP2CP0DJJ0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRGAP2CP0DJJ0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRGAP2CP0DJJ0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRGAP2CP0DJJ0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRGAP2CP0DJJ0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRGAP2CP0DJJ0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRGAP2CP0DJJ0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRGAP2CP0DJJ0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRGAP2CP0DJJ0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRGAP2CP0DJJ0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRGAP2CP0DJJ0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRGAP2CP0DJJ0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRGAP2CP0DJJ0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRGAP2CP0DJJ0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRGAP2CP0DJJ0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRGAP2CP0DJJ0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRGAP2CP0DJJ0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRGAP2CP0DJJ0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SRGAP2CP0DJJ0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRGAP2CP0DJJ0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRGAP2CP0DJJ0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRGAP2CP0DJJ0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRGAP2CP0DJJ0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRGAP2CP0DJJ0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRGAP2CP0DJJ0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRGAP2CP0DJJ0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRGAP2CP0DJJ0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRGAP2CP0DJJ0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SRGAP2CP0DJJ0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRGAP2CP0DJJ0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRGAP2CP0DJJ0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SRGAP2CP0DJJ0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRGAP2CP0DJJ0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRGAP2CP0DJJ0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRGAP2CP0DJJ0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRGAP2CP0DJJ0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRGAP2CP0DJJ0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRGAP2CP0DJJ0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRGAP2CP0DJJ0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRGAP2CP0DJJ0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRGAP2CP0DJJ0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRGAP2CP0DJJ0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRGAP2CP0DJJ0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRGAP2CP0DJJ0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRGAP2CP0DJJ0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRGAP2CP0DJJ0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRGAP2CP0DJJ0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SRGAP2CP0DJJ0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRGAP2CP0DJJ0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRGAP2CP0DJJ0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRGAP2CP0DJJ0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRGAP2CP0DJJ0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SRGAP2CP0DJJ0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRGAP2CP0DJJ0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRGAP2CP0DJJ0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRGAP2CP0DJJ0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRGAP2CP0DJJ0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRGAP2CP0DJJ0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRGAP2CP0DJJ0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRGAP2CP0DJJ0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRGAP2CP0DJJ0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRGAP2CP0DJJ0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRGAP2CP0DJJ0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRGAP2CP0DJJ0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SRGAP2CP0DJJ0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SRGAP2CP0DJJ0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms