Protein–RNA interactions for Protein: P0CG37

CFC1, Cryptic protein, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFC1P0CG37 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFC1P0CG37 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms