Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM200BP0CF97 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM200BP0CF97 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM200BP0CF97 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM200BP0CF97 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM200BP0CF97 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM200BP0CF97 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM200BP0CF97 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM200BP0CF97 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM200BP0CF97 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM200BP0CF97 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM200BP0CF97 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM200BP0CF97 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM200BP0CF97 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM200BP0CF97 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM200BP0CF97 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM200BP0CF97 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM200BP0CF97 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FAM200BP0CF97 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FAM200BP0CF97 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM200BP0CF97 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM200BP0CF97 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM200BP0CF97 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM200BP0CF97 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM200BP0CF97 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM200BP0CF97 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM200BP0CF97 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM200BP0CF97 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM200BP0CF97 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM200BP0CF97 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM200BP0CF97 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM200BP0CF97 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM200BP0CF97 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM200BP0CF97 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM200BP0CF97 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM200BP0CF97 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM200BP0CF97 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM200BP0CF97 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM200BP0CF97 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM200BP0CF97 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM200BP0CF97 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM200BP0CF97 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM200BP0CF97 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM200BP0CF97 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM200BP0CF97 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM200BP0CF97 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM200BP0CF97 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM200BP0CF97 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM200BP0CF97 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM200BP0CF97 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms