Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V6

SUPT20HL2, Putative transcription factor SPT20 homolog-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT20HL2P0C7V6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SUPT20HL2P0C7V6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SUPT20HL2P0C7V6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SUPT20HL2P0C7V6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SUPT20HL2P0C7V6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SUPT20HL2P0C7V6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SUPT20HL2P0C7V6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SUPT20HL2P0C7V6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SUPT20HL2P0C7V6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SUPT20HL2P0C7V6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SUPT20HL2P0C7V6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SUPT20HL2P0C7V6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SUPT20HL2P0C7V6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SUPT20HL2P0C7V6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SUPT20HL2P0C7V6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SUPT20HL2P0C7V6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SUPT20HL2P0C7V6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SUPT20HL2P0C7V6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SUPT20HL2P0C7V6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SUPT20HL2P0C7V6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SUPT20HL2P0C7V6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SUPT20HL2P0C7V6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SUPT20HL2P0C7V6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SUPT20HL2P0C7V6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SUPT20HL2P0C7V6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SUPT20HL2P0C7V6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SUPT20HL2P0C7V6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SUPT20HL2P0C7V6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SUPT20HL2P0C7V6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SUPT20HL2P0C7V6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SUPT20HL2P0C7V6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SUPT20HL2P0C7V6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SUPT20HL2P0C7V6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SUPT20HL2P0C7V6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SUPT20HL2P0C7V6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SUPT20HL2P0C7V6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SUPT20HL2P0C7V6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SUPT20HL2P0C7V6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SUPT20HL2P0C7V6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SUPT20HL2P0C7V6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SUPT20HL2P0C7V6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SUPT20HL2P0C7V6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SUPT20HL2P0C7V6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SUPT20HL2P0C7V6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SUPT20HL2P0C7V6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SUPT20HL2P0C7V6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SUPT20HL2P0C7V6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SUPT20HL2P0C7V6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SUPT20HL2P0C7V6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SUPT20HL2P0C7V6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SUPT20HL2P0C7V6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SUPT20HL2P0C7V6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SUPT20HL2P0C7V6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SUPT20HL2P0C7V6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SUPT20HL2P0C7V6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SUPT20HL2P0C7V6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SUPT20HL2P0C7V6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SUPT20HL2P0C7V6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SUPT20HL2P0C7V6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SUPT20HL2P0C7V6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SUPT20HL2P0C7V6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SUPT20HL2P0C7V6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SUPT20HL2P0C7V6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SUPT20HL2P0C7V6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SUPT20HL2P0C7V6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SUPT20HL2P0C7V6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SUPT20HL2P0C7V6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SUPT20HL2P0C7V6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SUPT20HL2P0C7V6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SUPT20HL2P0C7V6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SUPT20HL2P0C7V6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SUPT20HL2P0C7V6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SUPT20HL2P0C7V6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SUPT20HL2P0C7V6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SUPT20HL2P0C7V6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SUPT20HL2P0C7V6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SUPT20HL2P0C7V6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SUPT20HL2P0C7V6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SUPT20HL2P0C7V6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SUPT20HL2P0C7V6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SUPT20HL2P0C7V6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SUPT20HL2P0C7V6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SUPT20HL2P0C7V6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SUPT20HL2P0C7V6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SUPT20HL2P0C7V6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SUPT20HL2P0C7V6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SUPT20HL2P0C7V6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SUPT20HL2P0C7V6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SUPT20HL2P0C7V6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SUPT20HL2P0C7V6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SUPT20HL2P0C7V6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SUPT20HL2P0C7V6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SUPT20HL2P0C7V6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SUPT20HL2P0C7V6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SUPT20HL2P0C7V6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SUPT20HL2P0C7V6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SUPT20HL2P0C7V6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SUPT20HL2P0C7V6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SUPT20HL2P0C7V6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SUPT20HL2P0C7V6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms