Protein–RNA interactions for Protein: P09919

CSF3, Granulocyte colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3P09919 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF3P09919 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF3P09919 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF3P09919 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF3P09919 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF3P09919 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF3P09919 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF3P09919 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF3P09919 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF3P09919 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF3P09919 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF3P09919 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF3P09919 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF3P09919 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF3P09919 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF3P09919 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF3P09919 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF3P09919 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF3P09919 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF3P09919 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF3P09919 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSF3P09919 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSF3P09919 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSF3P09919 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSF3P09919 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSF3P09919 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSF3P09919 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSF3P09919 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSF3P09919 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSF3P09919 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSF3P09919 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSF3P09919 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSF3P09919 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CSF3P09919 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CSF3P09919 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSF3P09919 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSF3P09919 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSF3P09919 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF3P09919 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF3P09919 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF3P09919 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF3P09919 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF3P09919 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSF3P09919 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSF3P09919 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSF3P09919 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSF3P09919 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSF3P09919 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSF3P09919 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CSF3P09919 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF3P09919 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF3P09919 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF3P09919 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF3P09919 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF3P09919 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF3P09919 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF3P09919 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF3P09919 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF3P09919 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF3P09919 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF3P09919 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF3P09919 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF3P09919 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF3P09919 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF3P09919 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF3P09919 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF3P09919 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF3P09919 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF3P09919 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF3P09919 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF3P09919 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF3P09919 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF3P09919 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF3P09919 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF3P09919 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF3P09919 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF3P09919 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF3P09919 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF3P09919 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF3P09919 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF3P09919 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF3P09919 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF3P09919 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF3P09919 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF3P09919 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSF3P09919 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CSF3P09919 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSF3P09919 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF3P09919 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF3P09919 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF3P09919 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF3P09919 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF3P09919 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF3P09919 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF3P09919 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF3P09919 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF3P09919 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF3P09919 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF3P09919 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF3P09919 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms