Protein–RNA interactions for Protein: P09630

HOXC6, Homeobox protein Hox-C6, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6P09630 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HOXC6P09630 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HOXC6P09630 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
HOXC6P09630 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HOXC6P09630 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HOXC6P09630 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HOXC6P09630 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HOXC6P09630 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HOXC6P09630 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HOXC6P09630 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HOXC6P09630 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HOXC6P09630 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HOXC6P09630 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HOXC6P09630 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HOXC6P09630 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HOXC6P09630 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HOXC6P09630 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.54■■■□□ 2
HOXC6P09630 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HOXC6P09630 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HOXC6P09630 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HOXC6P09630 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
HOXC6P09630 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.53■■■□□ 2
HOXC6P09630 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HOXC6P09630 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HOXC6P09630 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HOXC6P09630 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXC6P09630 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXC6P09630 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXC6P09630 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXC6P09630 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXC6P09630 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXC6P09630 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXC6P09630 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXC6P09630 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXC6P09630 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXC6P09630 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXC6P09630 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXC6P09630 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXC6P09630 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXC6P09630 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXC6P09630 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXC6P09630 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXC6P09630 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXC6P09630 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXC6P09630 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXC6P09630 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXC6P09630 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXC6P09630 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXC6P09630 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXC6P09630 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXC6P09630 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXC6P09630 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXC6P09630 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXC6P09630 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXC6P09630 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HOXC6P09630 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HOXC6P09630 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXC6P09630 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXC6P09630 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXC6P09630 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXC6P09630 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXC6P09630 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXC6P09630 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXC6P09630 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXC6P09630 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXC6P09630 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXC6P09630 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXC6P09630 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXC6P09630 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXC6P09630 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXC6P09630 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXC6P09630 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXC6P09630 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXC6P09630 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXC6P09630 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXC6P09630 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXC6P09630 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXC6P09630 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXC6P09630 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXC6P09630 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXC6P09630 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXC6P09630 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXC6P09630 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXC6P09630 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC6P09630 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC6P09630 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC6P09630 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC6P09630 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXC6P09630 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXC6P09630 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXC6P09630 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXC6P09630 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HOXC6P09630 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXC6P09630 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXC6P09630 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXC6P09630 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXC6P09630 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXC6P09630 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXC6P09630 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXC6P09630 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms