Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOA4P06727 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOA4P06727 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOA4P06727 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOA4P06727 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOA4P06727 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOA4P06727 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APOA4P06727 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24■■□□□ 1.43
APOA4P06727 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
APOA4P06727 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
APOA4P06727 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOA4P06727 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOA4P06727 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOA4P06727 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOA4P06727 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOA4P06727 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOA4P06727 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOA4P06727 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
APOA4P06727 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
APOA4P06727 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOA4P06727 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOA4P06727 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
APOA4P06727 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOA4P06727 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOA4P06727 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOA4P06727 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOA4P06727 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOA4P06727 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOA4P06727 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOA4P06727 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOA4P06727 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOA4P06727 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOA4P06727 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOA4P06727 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOA4P06727 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOA4P06727 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
APOA4P06727 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOA4P06727 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOA4P06727 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOA4P06727 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOA4P06727 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOA4P06727 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOA4P06727 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOA4P06727 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
APOA4P06727 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOA4P06727 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOA4P06727 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
APOA4P06727 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOA4P06727 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOA4P06727 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOA4P06727 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOA4P06727 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOA4P06727 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOA4P06727 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
APOA4P06727 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOA4P06727 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOA4P06727 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOA4P06727 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOA4P06727 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOA4P06727 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOA4P06727 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOA4P06727 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOA4P06727 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOA4P06727 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOA4P06727 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOA4P06727 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOA4P06727 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOA4P06727 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOA4P06727 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOA4P06727 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOA4P06727 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOA4P06727 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOA4P06727 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOA4P06727 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOA4P06727 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOA4P06727 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOA4P06727 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOA4P06727 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOA4P06727 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOA4P06727 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOA4P06727 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOA4P06727 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOA4P06727 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
APOA4P06727 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOA4P06727 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOA4P06727 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOA4P06727 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOA4P06727 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOA4P06727 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOA4P06727 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOA4P06727 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOA4P06727 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOA4P06727 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOA4P06727 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOA4P06727 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOA4P06727 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOA4P06727 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
APOA4P06727 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOA4P06727 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOA4P06727 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms