Protein–RNA interactions for Protein: P05549

TFAP2A, Transcription factor AP-2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2AP05549 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFAP2AP05549 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TFAP2AP05549 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TFAP2AP05549 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFAP2AP05549 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFAP2AP05549 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFAP2AP05549 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFAP2AP05549 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFAP2AP05549 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFAP2AP05549 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFAP2AP05549 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFAP2AP05549 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFAP2AP05549 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TFAP2AP05549 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFAP2AP05549 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TFAP2AP05549 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFAP2AP05549 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFAP2AP05549 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFAP2AP05549 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFAP2AP05549 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFAP2AP05549 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFAP2AP05549 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFAP2AP05549 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFAP2AP05549 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFAP2AP05549 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFAP2AP05549 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFAP2AP05549 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TFAP2AP05549 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFAP2AP05549 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFAP2AP05549 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFAP2AP05549 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFAP2AP05549 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFAP2AP05549 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TFAP2AP05549 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFAP2AP05549 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFAP2AP05549 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFAP2AP05549 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFAP2AP05549 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFAP2AP05549 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFAP2AP05549 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFAP2AP05549 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFAP2AP05549 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TFAP2AP05549 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms