Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCGP05129 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCGP05129 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCGP05129 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCGP05129 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCGP05129 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCGP05129 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCGP05129 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCGP05129 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCGP05129 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCGP05129 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCGP05129 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCGP05129 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCGP05129 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCGP05129 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCGP05129 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCGP05129 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCGP05129 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCGP05129 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCGP05129 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCGP05129 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRKCGP05129 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRKCGP05129 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRKCGP05129 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKCGP05129 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCGP05129 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCGP05129 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCGP05129 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCGP05129 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCGP05129 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCGP05129 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCGP05129 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCGP05129 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCGP05129 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCGP05129 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCGP05129 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCGP05129 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCGP05129 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCGP05129 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCGP05129 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCGP05129 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCGP05129 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCGP05129 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCGP05129 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCGP05129 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCGP05129 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCGP05129 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCGP05129 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCGP05129 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCGP05129 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCGP05129 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCGP05129 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCGP05129 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCGP05129 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCGP05129 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCGP05129 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCGP05129 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms