Protein–RNA interactions for Protein: P05026

ATP1B1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B1P05026 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP1B1P05026 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP1B1P05026 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP1B1P05026 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP1B1P05026 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP1B1P05026 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP1B1P05026 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP1B1P05026 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1B1P05026 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1B1P05026 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1B1P05026 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1B1P05026 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1B1P05026 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1B1P05026 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1B1P05026 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1B1P05026 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1B1P05026 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1B1P05026 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1B1P05026 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1B1P05026 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1B1P05026 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1B1P05026 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1B1P05026 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1B1P05026 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1B1P05026 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1B1P05026 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1B1P05026 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1B1P05026 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1B1P05026 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1B1P05026 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1B1P05026 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1B1P05026 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1B1P05026 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1B1P05026 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1B1P05026 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1B1P05026 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1B1P05026 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1B1P05026 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP1B1P05026 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP1B1P05026 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP1B1P05026 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP1B1P05026 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP1B1P05026 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP1B1P05026 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP1B1P05026 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP1B1P05026 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP1B1P05026 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP1B1P05026 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP1B1P05026 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms