Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFNA4P05014 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFNA4P05014 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFNA4P05014 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFNA4P05014 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFNA4P05014 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFNA4P05014 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFNA4P05014 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFNA4P05014 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFNA4P05014 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFNA4P05014 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFNA4P05014 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFNA4P05014 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFNA4P05014 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFNA4P05014 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFNA4P05014 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFNA4P05014 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFNA4P05014 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFNA4P05014 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFNA4P05014 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFNA4P05014 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFNA4P05014 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFNA4P05014 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFNA4P05014 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFNA4P05014 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFNA4P05014 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFNA4P05014 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFNA4P05014 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFNA4P05014 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFNA4P05014 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFNA4P05014 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFNA4P05014 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFNA4P05014 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFNA4P05014 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFNA4P05014 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFNA4P05014 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFNA4P05014 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFNA4P05014 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFNA4P05014 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFNA4P05014 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFNA4P05014 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFNA4P05014 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFNA4P05014 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFNA4P05014 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms