Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FGAP02671 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FGAP02671 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FGAP02671 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
FGAP02671 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
FGAP02671 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FGAP02671 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FGAP02671 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FGAP02671 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FGAP02671 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FGAP02671 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
FGAP02671 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
FGAP02671 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
FGAP02671 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
FGAP02671 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FGAP02671 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FGAP02671 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FGAP02671 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FGAP02671 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FGAP02671 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FGAP02671 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FGAP02671 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FGAP02671 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FGAP02671 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FGAP02671 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FGAP02671 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FGAP02671 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
FGAP02671 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
FGAP02671 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FGAP02671 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FGAP02671 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
FGAP02671 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FGAP02671 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FGAP02671 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FGAP02671 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
FGAP02671 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FGAP02671 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FGAP02671 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FGAP02671 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FGAP02671 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FGAP02671 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FGAP02671 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
FGAP02671 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FGAP02671 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FGAP02671 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FGAP02671 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FGAP02671 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
FGAP02671 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
FGAP02671 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FGAP02671 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FGAP02671 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FGAP02671 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FGAP02671 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FGAP02671 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FGAP02671 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
FGAP02671 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FGAP02671 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FGAP02671 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FGAP02671 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FGAP02671 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FGAP02671 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FGAP02671 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FGAP02671 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FGAP02671 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FGAP02671 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FGAP02671 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FGAP02671 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FGAP02671 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FGAP02671 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FGAP02671 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FGAP02671 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FGAP02671 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FGAP02671 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FGAP02671 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FGAP02671 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FGAP02671 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FGAP02671 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FGAP02671 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
FGAP02671 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FGAP02671 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FGAP02671 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FGAP02671 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FGAP02671 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FGAP02671 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FGAP02671 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FGAP02671 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FGAP02671 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FGAP02671 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FGAP02671 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FGAP02671 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FGAP02671 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FGAP02671 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FGAP02671 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FGAP02671 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FGAP02671 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FGAP02671 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FGAP02671 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FGAP02671 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FGAP02671 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FGAP02671 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms