Protein–RNA interactions for Protein: P01733

TRBV12-3, T-cell receptor beta chain V region YT35, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV12-3P01733 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRBV12-3P01733 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TRBV12-3P01733 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRBV12-3P01733 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRBV12-3P01733 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRBV12-3P01733 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRBV12-3P01733 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRBV12-3P01733 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRBV12-3P01733 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRBV12-3P01733 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRBV12-3P01733 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRBV12-3P01733 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRBV12-3P01733 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRBV12-3P01733 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRBV12-3P01733 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TRBV12-3P01733 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRBV12-3P01733 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRBV12-3P01733 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRBV12-3P01733 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.1 ms