Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
F9P00740 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
F9P00740 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
F9P00740 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
F9P00740 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
F9P00740 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
F9P00740 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
F9P00740 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
F9P00740 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
F9P00740 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
F9P00740 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
F9P00740 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
F9P00740 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
F9P00740 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
F9P00740 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
F9P00740 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
F9P00740 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
F9P00740 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
F9P00740 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
F9P00740 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
F9P00740 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
F9P00740 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
F9P00740 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
F9P00740 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
F9P00740 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
F9P00740 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
F9P00740 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
F9P00740 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
F9P00740 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
F9P00740 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
F9P00740 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
F9P00740 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
F9P00740 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
F9P00740 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
F9P00740 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
F9P00740 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
F9P00740 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
F9P00740 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
F9P00740 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
F9P00740 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
F9P00740 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
F9P00740 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
F9P00740 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
F9P00740 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
F9P00740 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
F9P00740 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
F9P00740 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
F9P00740 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
F9P00740 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
F9P00740 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
F9P00740 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
F9P00740 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
F9P00740 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
F9P00740 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
F9P00740 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
F9P00740 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
F9P00740 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
F9P00740 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
F9P00740 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
F9P00740 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
F9P00740 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
F9P00740 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
F9P00740 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
F9P00740 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
F9P00740 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
F9P00740 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
F9P00740 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
F9P00740 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
F9P00740 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
F9P00740 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
F9P00740 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
F9P00740 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
F9P00740 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
F9P00740 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
F9P00740 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
F9P00740 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
F9P00740 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
F9P00740 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
F9P00740 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
F9P00740 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
F9P00740 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
F9P00740 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
F9P00740 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
F9P00740 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
F9P00740 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
F9P00740 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
F9P00740 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
F9P00740 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
F9P00740 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
F9P00740 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
F9P00740 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
F9P00740 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
F9P00740 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
F9P00740 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
F9P00740 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
F9P00740 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
F9P00740 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
F9P00740 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
F9P00740 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
F9P00740 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms