Protein–RNA interactions for Protein: O95704

APBB3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBB3O95704 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APBB3O95704 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APBB3O95704 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APBB3O95704 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APBB3O95704 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APBB3O95704 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APBB3O95704 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APBB3O95704 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
APBB3O95704 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APBB3O95704 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APBB3O95704 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APBB3O95704 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APBB3O95704 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APBB3O95704 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APBB3O95704 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APBB3O95704 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APBB3O95704 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APBB3O95704 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APBB3O95704 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APBB3O95704 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APBB3O95704 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APBB3O95704 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APBB3O95704 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
APBB3O95704 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APBB3O95704 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APBB3O95704 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APBB3O95704 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APBB3O95704 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APBB3O95704 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APBB3O95704 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APBB3O95704 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
APBB3O95704 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APBB3O95704 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APBB3O95704 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
APBB3O95704 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APBB3O95704 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APBB3O95704 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APBB3O95704 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APBB3O95704 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APBB3O95704 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
APBB3O95704 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APBB3O95704 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APBB3O95704 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APBB3O95704 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APBB3O95704 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APBB3O95704 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APBB3O95704 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APBB3O95704 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APBB3O95704 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
APBB3O95704 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APBB3O95704 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APBB3O95704 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APBB3O95704 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APBB3O95704 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APBB3O95704 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APBB3O95704 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APBB3O95704 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
APBB3O95704 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APBB3O95704 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APBB3O95704 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APBB3O95704 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APBB3O95704 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APBB3O95704 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APBB3O95704 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
APBB3O95704 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
APBB3O95704 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APBB3O95704 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
APBB3O95704 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APBB3O95704 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APBB3O95704 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APBB3O95704 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APBB3O95704 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APBB3O95704 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APBB3O95704 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APBB3O95704 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APBB3O95704 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APBB3O95704 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APBB3O95704 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APBB3O95704 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
APBB3O95704 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APBB3O95704 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APBB3O95704 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APBB3O95704 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APBB3O95704 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APBB3O95704 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APBB3O95704 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APBB3O95704 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APBB3O95704 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APBB3O95704 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APBB3O95704 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
APBB3O95704 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
APBB3O95704 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APBB3O95704 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APBB3O95704 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APBB3O95704 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APBB3O95704 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APBB3O95704 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APBB3O95704 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APBB3O95704 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APBB3O95704 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms