Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAPLNO95428 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAPLNO95428 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAPLNO95428 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAPLNO95428 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAPLNO95428 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAPLNO95428 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PAPLNO95428 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAPLNO95428 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAPLNO95428 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PAPLNO95428 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAPLNO95428 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAPLNO95428 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAPLNO95428 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAPLNO95428 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAPLNO95428 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAPLNO95428 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAPLNO95428 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAPLNO95428 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PAPLNO95428 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAPLNO95428 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PAPLNO95428 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PAPLNO95428 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PAPLNO95428 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAPLNO95428 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAPLNO95428 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAPLNO95428 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAPLNO95428 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAPLNO95428 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAPLNO95428 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAPLNO95428 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAPLNO95428 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAPLNO95428 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAPLNO95428 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAPLNO95428 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAPLNO95428 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAPLNO95428 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAPLNO95428 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAPLNO95428 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAPLNO95428 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAPLNO95428 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAPLNO95428 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAPLNO95428 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAPLNO95428 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAPLNO95428 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAPLNO95428 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAPLNO95428 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAPLNO95428 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAPLNO95428 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAPLNO95428 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAPLNO95428 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAPLNO95428 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PAPLNO95428 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAPLNO95428 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAPLNO95428 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAPLNO95428 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAPLNO95428 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PAPLNO95428 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAPLNO95428 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAPLNO95428 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PAPLNO95428 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAPLNO95428 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAPLNO95428 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PAPLNO95428 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PAPLNO95428 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAPLNO95428 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAPLNO95428 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAPLNO95428 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAPLNO95428 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAPLNO95428 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAPLNO95428 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAPLNO95428 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAPLNO95428 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAPLNO95428 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAPLNO95428 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAPLNO95428 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAPLNO95428 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAPLNO95428 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAPLNO95428 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PAPLNO95428 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAPLNO95428 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAPLNO95428 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAPLNO95428 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAPLNO95428 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAPLNO95428 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAPLNO95428 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PAPLNO95428 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAPLNO95428 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAPLNO95428 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAPLNO95428 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAPLNO95428 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAPLNO95428 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAPLNO95428 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAPLNO95428 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAPLNO95428 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAPLNO95428 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAPLNO95428 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAPLNO95428 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PAPLNO95428 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PAPLNO95428 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms