Protein–RNA interactions for Protein: O75764

TCEA3, Transcription elongation factor A protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA3O75764 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCEA3O75764 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCEA3O75764 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCEA3O75764 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCEA3O75764 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCEA3O75764 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCEA3O75764 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCEA3O75764 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCEA3O75764 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCEA3O75764 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCEA3O75764 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCEA3O75764 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TCEA3O75764 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCEA3O75764 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCEA3O75764 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCEA3O75764 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCEA3O75764 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCEA3O75764 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCEA3O75764 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCEA3O75764 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCEA3O75764 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCEA3O75764 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCEA3O75764 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCEA3O75764 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCEA3O75764 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCEA3O75764 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TCEA3O75764 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCEA3O75764 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCEA3O75764 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCEA3O75764 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCEA3O75764 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCEA3O75764 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCEA3O75764 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCEA3O75764 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCEA3O75764 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCEA3O75764 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCEA3O75764 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCEA3O75764 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCEA3O75764 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCEA3O75764 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCEA3O75764 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCEA3O75764 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCEA3O75764 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCEA3O75764 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCEA3O75764 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCEA3O75764 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TCEA3O75764 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TCEA3O75764 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCEA3O75764 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCEA3O75764 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCEA3O75764 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCEA3O75764 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCEA3O75764 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCEA3O75764 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCEA3O75764 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCEA3O75764 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCEA3O75764 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCEA3O75764 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCEA3O75764 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCEA3O75764 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCEA3O75764 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCEA3O75764 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCEA3O75764 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TCEA3O75764 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCEA3O75764 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCEA3O75764 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCEA3O75764 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCEA3O75764 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCEA3O75764 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCEA3O75764 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCEA3O75764 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCEA3O75764 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCEA3O75764 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCEA3O75764 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCEA3O75764 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCEA3O75764 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCEA3O75764 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCEA3O75764 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCEA3O75764 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCEA3O75764 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCEA3O75764 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCEA3O75764 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCEA3O75764 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCEA3O75764 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCEA3O75764 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCEA3O75764 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCEA3O75764 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCEA3O75764 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCEA3O75764 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCEA3O75764 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCEA3O75764 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCEA3O75764 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCEA3O75764 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TCEA3O75764 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCEA3O75764 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TCEA3O75764 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCEA3O75764 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCEA3O75764 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCEA3O75764 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCEA3O75764 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms