Protein–RNA interactions for Protein: O75679

RFPL3, Ret finger protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL3O75679 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFPL3O75679 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RFPL3O75679 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFPL3O75679 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFPL3O75679 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFPL3O75679 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFPL3O75679 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFPL3O75679 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFPL3O75679 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFPL3O75679 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFPL3O75679 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFPL3O75679 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RFPL3O75679 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFPL3O75679 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFPL3O75679 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RFPL3O75679 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFPL3O75679 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFPL3O75679 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFPL3O75679 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFPL3O75679 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFPL3O75679 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFPL3O75679 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFPL3O75679 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFPL3O75679 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFPL3O75679 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFPL3O75679 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFPL3O75679 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFPL3O75679 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFPL3O75679 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RFPL3O75679 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RFPL3O75679 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFPL3O75679 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFPL3O75679 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFPL3O75679 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFPL3O75679 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFPL3O75679 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFPL3O75679 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFPL3O75679 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFPL3O75679 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFPL3O75679 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFPL3O75679 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFPL3O75679 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFPL3O75679 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFPL3O75679 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFPL3O75679 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFPL3O75679 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFPL3O75679 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFPL3O75679 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFPL3O75679 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFPL3O75679 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFPL3O75679 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFPL3O75679 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFPL3O75679 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFPL3O75679 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFPL3O75679 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFPL3O75679 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RFPL3O75679 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFPL3O75679 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFPL3O75679 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFPL3O75679 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFPL3O75679 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RFPL3O75679 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RFPL3O75679 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RFPL3O75679 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFPL3O75679 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFPL3O75679 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFPL3O75679 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFPL3O75679 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFPL3O75679 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFPL3O75679 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFPL3O75679 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFPL3O75679 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFPL3O75679 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFPL3O75679 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFPL3O75679 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFPL3O75679 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFPL3O75679 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFPL3O75679 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFPL3O75679 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RFPL3O75679 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFPL3O75679 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFPL3O75679 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFPL3O75679 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFPL3O75679 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFPL3O75679 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFPL3O75679 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFPL3O75679 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFPL3O75679 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFPL3O75679 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFPL3O75679 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFPL3O75679 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFPL3O75679 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFPL3O75679 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFPL3O75679 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFPL3O75679 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFPL3O75679 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFPL3O75679 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFPL3O75679 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFPL3O75679 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFPL3O75679 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms