Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKAP2O75563 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKAP2O75563 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKAP2O75563 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKAP2O75563 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SKAP2O75563 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SKAP2O75563 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKAP2O75563 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SKAP2O75563 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKAP2O75563 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKAP2O75563 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKAP2O75563 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms