Protein–RNA interactions for Protein: O75446

SAP30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP30O75446 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAP30O75446 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAP30O75446 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAP30O75446 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAP30O75446 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAP30O75446 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAP30O75446 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAP30O75446 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAP30O75446 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAP30O75446 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SAP30O75446 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAP30O75446 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SAP30O75446 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAP30O75446 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAP30O75446 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAP30O75446 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAP30O75446 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAP30O75446 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAP30O75446 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAP30O75446 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAP30O75446 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAP30O75446 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAP30O75446 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAP30O75446 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAP30O75446 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAP30O75446 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAP30O75446 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAP30O75446 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAP30O75446 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAP30O75446 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAP30O75446 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAP30O75446 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SAP30O75446 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SAP30O75446 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAP30O75446 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAP30O75446 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAP30O75446 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAP30O75446 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAP30O75446 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SAP30O75446 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAP30O75446 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAP30O75446 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAP30O75446 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAP30O75446 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SAP30O75446 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAP30O75446 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAP30O75446 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAP30O75446 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAP30O75446 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAP30O75446 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAP30O75446 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAP30O75446 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAP30O75446 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAP30O75446 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAP30O75446 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SAP30O75446 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAP30O75446 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAP30O75446 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAP30O75446 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAP30O75446 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAP30O75446 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAP30O75446 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SAP30O75446 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAP30O75446 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAP30O75446 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAP30O75446 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAP30O75446 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAP30O75446 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAP30O75446 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAP30O75446 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAP30O75446 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAP30O75446 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAP30O75446 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAP30O75446 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAP30O75446 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAP30O75446 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAP30O75446 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAP30O75446 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAP30O75446 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAP30O75446 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAP30O75446 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAP30O75446 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAP30O75446 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAP30O75446 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAP30O75446 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAP30O75446 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAP30O75446 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SAP30O75446 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAP30O75446 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAP30O75446 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAP30O75446 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAP30O75446 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAP30O75446 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAP30O75446 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAP30O75446 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAP30O75446 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAP30O75446 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAP30O75446 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAP30O75446 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAP30O75446 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms