Protein–RNA interactions for Protein: O60565

GREM1, Gremlin-1, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREM1O60565 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GREM1O60565 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GREM1O60565 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GREM1O60565 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GREM1O60565 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GREM1O60565 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GREM1O60565 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GREM1O60565 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GREM1O60565 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GREM1O60565 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GREM1O60565 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GREM1O60565 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GREM1O60565 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GREM1O60565 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GREM1O60565 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GREM1O60565 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GREM1O60565 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GREM1O60565 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GREM1O60565 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GREM1O60565 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GREM1O60565 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GREM1O60565 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GREM1O60565 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GREM1O60565 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GREM1O60565 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GREM1O60565 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GREM1O60565 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GREM1O60565 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GREM1O60565 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GREM1O60565 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GREM1O60565 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GREM1O60565 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GREM1O60565 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GREM1O60565 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GREM1O60565 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GREM1O60565 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GREM1O60565 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GREM1O60565 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GREM1O60565 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GREM1O60565 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GREM1O60565 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GREM1O60565 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GREM1O60565 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GREM1O60565 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GREM1O60565 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GREM1O60565 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GREM1O60565 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GREM1O60565 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GREM1O60565 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GREM1O60565 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GREM1O60565 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GREM1O60565 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GREM1O60565 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GREM1O60565 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GREM1O60565 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GREM1O60565 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GREM1O60565 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GREM1O60565 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GREM1O60565 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GREM1O60565 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GREM1O60565 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GREM1O60565 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GREM1O60565 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GREM1O60565 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GREM1O60565 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GREM1O60565 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GREM1O60565 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GREM1O60565 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GREM1O60565 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GREM1O60565 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GREM1O60565 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GREM1O60565 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GREM1O60565 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GREM1O60565 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GREM1O60565 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GREM1O60565 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GREM1O60565 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GREM1O60565 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GREM1O60565 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GREM1O60565 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GREM1O60565 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GREM1O60565 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GREM1O60565 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GREM1O60565 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GREM1O60565 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GREM1O60565 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GREM1O60565 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GREM1O60565 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GREM1O60565 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GREM1O60565 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GREM1O60565 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GREM1O60565 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GREM1O60565 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GREM1O60565 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GREM1O60565 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GREM1O60565 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GREM1O60565 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GREM1O60565 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GREM1O60565 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GREM1O60565 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
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