Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GMDSO60547 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GMDSO60547 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GMDSO60547 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GMDSO60547 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GMDSO60547 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GMDSO60547 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GMDSO60547 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GMDSO60547 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GMDSO60547 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GMDSO60547 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GMDSO60547 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GMDSO60547 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GMDSO60547 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GMDSO60547 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GMDSO60547 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GMDSO60547 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GMDSO60547 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GMDSO60547 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GMDSO60547 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GMDSO60547 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GMDSO60547 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GMDSO60547 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GMDSO60547 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GMDSO60547 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GMDSO60547 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GMDSO60547 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GMDSO60547 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GMDSO60547 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GMDSO60547 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GMDSO60547 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GMDSO60547 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GMDSO60547 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GMDSO60547 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GMDSO60547 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GMDSO60547 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GMDSO60547 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GMDSO60547 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GMDSO60547 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GMDSO60547 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GMDSO60547 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GMDSO60547 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GMDSO60547 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GMDSO60547 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GMDSO60547 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GMDSO60547 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GMDSO60547 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GMDSO60547 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GMDSO60547 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GMDSO60547 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GMDSO60547 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GMDSO60547 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GMDSO60547 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GMDSO60547 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GMDSO60547 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GMDSO60547 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GMDSO60547 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GMDSO60547 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GMDSO60547 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GMDSO60547 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GMDSO60547 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GMDSO60547 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GMDSO60547 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GMDSO60547 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GMDSO60547 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GMDSO60547 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GMDSO60547 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GMDSO60547 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GMDSO60547 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GMDSO60547 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GMDSO60547 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GMDSO60547 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GMDSO60547 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GMDSO60547 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GMDSO60547 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GMDSO60547 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GMDSO60547 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GMDSO60547 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GMDSO60547 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GMDSO60547 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GMDSO60547 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GMDSO60547 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GMDSO60547 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GMDSO60547 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GMDSO60547 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GMDSO60547 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GMDSO60547 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GMDSO60547 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GMDSO60547 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GMDSO60547 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GMDSO60547 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GMDSO60547 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GMDSO60547 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GMDSO60547 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GMDSO60547 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GMDSO60547 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GMDSO60547 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GMDSO60547 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GMDSO60547 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GMDSO60547 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms