Protein–RNA interactions for Protein: O60356

NUPR1, Nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPR1O60356 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUPR1O60356 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUPR1O60356 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUPR1O60356 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUPR1O60356 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUPR1O60356 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUPR1O60356 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUPR1O60356 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUPR1O60356 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUPR1O60356 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUPR1O60356 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUPR1O60356 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUPR1O60356 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUPR1O60356 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUPR1O60356 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUPR1O60356 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUPR1O60356 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUPR1O60356 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUPR1O60356 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUPR1O60356 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUPR1O60356 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUPR1O60356 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUPR1O60356 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUPR1O60356 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUPR1O60356 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUPR1O60356 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUPR1O60356 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUPR1O60356 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUPR1O60356 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUPR1O60356 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUPR1O60356 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUPR1O60356 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUPR1O60356 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUPR1O60356 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUPR1O60356 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUPR1O60356 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUPR1O60356 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUPR1O60356 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUPR1O60356 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUPR1O60356 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUPR1O60356 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NUPR1O60356 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUPR1O60356 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUPR1O60356 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 470.8 ms