Protein–RNA interactions for Protein: O60315

ZEB2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB2O60315 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZEB2O60315 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZEB2O60315 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZEB2O60315 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZEB2O60315 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZEB2O60315 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZEB2O60315 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZEB2O60315 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZEB2O60315 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZEB2O60315 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZEB2O60315 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZEB2O60315 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZEB2O60315 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZEB2O60315 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZEB2O60315 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZEB2O60315 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZEB2O60315 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZEB2O60315 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZEB2O60315 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZEB2O60315 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZEB2O60315 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZEB2O60315 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZEB2O60315 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZEB2O60315 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZEB2O60315 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZEB2O60315 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZEB2O60315 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ZEB2O60315 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZEB2O60315 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZEB2O60315 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ZEB2O60315 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZEB2O60315 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZEB2O60315 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZEB2O60315 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZEB2O60315 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZEB2O60315 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZEB2O60315 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZEB2O60315 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZEB2O60315 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZEB2O60315 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZEB2O60315 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZEB2O60315 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZEB2O60315 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ZEB2O60315 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZEB2O60315 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZEB2O60315 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZEB2O60315 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZEB2O60315 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZEB2O60315 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZEB2O60315 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZEB2O60315 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZEB2O60315 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZEB2O60315 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZEB2O60315 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZEB2O60315 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms