Protein–RNA interactions for Protein: O43933

PEX1, Peroxisome biogenesis factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX1O43933 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX1O43933 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX1O43933 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX1O43933 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX1O43933 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX1O43933 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX1O43933 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX1O43933 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.31
PEX1O43933 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX1O43933 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX1O43933 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX1O43933 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX1O43933 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX1O43933 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX1O43933 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX1O43933 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX1O43933 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX1O43933 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX1O43933 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX1O43933 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX1O43933 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX1O43933 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX1O43933 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX1O43933 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX1O43933 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX1O43933 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX1O43933 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX1O43933 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX1O43933 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX1O43933 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX1O43933 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX1O43933 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX1O43933 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX1O43933 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX1O43933 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX1O43933 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX1O43933 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX1O43933 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX1O43933 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX1O43933 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX1O43933 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX1O43933 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX1O43933 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX1O43933 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX1O43933 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX1O43933 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX1O43933 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX1O43933 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX1O43933 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX1O43933 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX1O43933 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX1O43933 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX1O43933 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX1O43933 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX1O43933 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX1O43933 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX1O43933 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PEX1O43933 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PEX1O43933 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PEX1O43933 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX1O43933 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX1O43933 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX1O43933 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX1O43933 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX1O43933 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX1O43933 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX1O43933 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX1O43933 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX1O43933 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX1O43933 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX1O43933 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX1O43933 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX1O43933 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX1O43933 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX1O43933 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX1O43933 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX1O43933 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEX1O43933 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEX1O43933 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEX1O43933 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEX1O43933 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEX1O43933 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEX1O43933 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEX1O43933 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEX1O43933 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX1O43933 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX1O43933 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX1O43933 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX1O43933 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX1O43933 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX1O43933 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX1O43933 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX1O43933 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX1O43933 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX1O43933 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX1O43933 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX1O43933 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX1O43933 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX1O43933 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PEX1O43933 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms