Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC25A20O43772 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC25A20O43772 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms