Protein–RNA interactions for Protein: O43734

TRAF3IP2, Adapter protein CIKS, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2O43734 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF3IP2O43734 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF3IP2O43734 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF3IP2O43734 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF3IP2O43734 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF3IP2O43734 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF3IP2O43734 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF3IP2O43734 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF3IP2O43734 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF3IP2O43734 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF3IP2O43734 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF3IP2O43734 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF3IP2O43734 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF3IP2O43734 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF3IP2O43734 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF3IP2O43734 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF3IP2O43734 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF3IP2O43734 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF3IP2O43734 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF3IP2O43734 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF3IP2O43734 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF3IP2O43734 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF3IP2O43734 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF3IP2O43734 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF3IP2O43734 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF3IP2O43734 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF3IP2O43734 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF3IP2O43734 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF3IP2O43734 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF3IP2O43734 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF3IP2O43734 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF3IP2O43734 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF3IP2O43734 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF3IP2O43734 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF3IP2O43734 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF3IP2O43734 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF3IP2O43734 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRAF3IP2O43734 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRAF3IP2O43734 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF3IP2O43734 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRAF3IP2O43734 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF3IP2O43734 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF3IP2O43734 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF3IP2O43734 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF3IP2O43734 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF3IP2O43734 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF3IP2O43734 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF3IP2O43734 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF3IP2O43734 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF3IP2O43734 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms