Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
HTATSF1O43719 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
HTATSF1O43719 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
HTATSF1O43719 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
HTATSF1O43719 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
HTATSF1O43719 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
HTATSF1O43719 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
HTATSF1O43719 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
HTATSF1O43719 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
HTATSF1O43719 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
HTATSF1O43719 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
HTATSF1O43719 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
HTATSF1O43719 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
HTATSF1O43719 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
HTATSF1O43719 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
HTATSF1O43719 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
HTATSF1O43719 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
HTATSF1O43719 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
HTATSF1O43719 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
HTATSF1O43719 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
HTATSF1O43719 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
HTATSF1O43719 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
HTATSF1O43719 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
HTATSF1O43719 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
HTATSF1O43719 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
HTATSF1O43719 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
HTATSF1O43719 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
HTATSF1O43719 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
HTATSF1O43719 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
HTATSF1O43719 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
HTATSF1O43719 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
HTATSF1O43719 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
HTATSF1O43719 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
HTATSF1O43719 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
HTATSF1O43719 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
HTATSF1O43719 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
HTATSF1O43719 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
HTATSF1O43719 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
HTATSF1O43719 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
HTATSF1O43719 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
HTATSF1O43719 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
HTATSF1O43719 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
HTATSF1O43719 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
HTATSF1O43719 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
HTATSF1O43719 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
HTATSF1O43719 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
HTATSF1O43719 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
HTATSF1O43719 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
HTATSF1O43719 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
HTATSF1O43719 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
HTATSF1O43719 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
HTATSF1O43719 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
HTATSF1O43719 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
HTATSF1O43719 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
HTATSF1O43719 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
HTATSF1O43719 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HTATSF1O43719 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HTATSF1O43719 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HTATSF1O43719 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
HTATSF1O43719 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
HTATSF1O43719 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HTATSF1O43719 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HTATSF1O43719 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HTATSF1O43719 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
HTATSF1O43719 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
HTATSF1O43719 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
HTATSF1O43719 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
HTATSF1O43719 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
HTATSF1O43719 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
HTATSF1O43719 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
HTATSF1O43719 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
HTATSF1O43719 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
HTATSF1O43719 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
HTATSF1O43719 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
HTATSF1O43719 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
HTATSF1O43719 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
HTATSF1O43719 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
HTATSF1O43719 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
HTATSF1O43719 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
HTATSF1O43719 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
HTATSF1O43719 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
HTATSF1O43719 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
HTATSF1O43719 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
HTATSF1O43719 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
HTATSF1O43719 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
HTATSF1O43719 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
HTATSF1O43719 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
HTATSF1O43719 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
HTATSF1O43719 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
HTATSF1O43719 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
HTATSF1O43719 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
HTATSF1O43719 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC31.32■■■□□ 2.61
HTATSF1O43719 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
HTATSF1O43719 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
HTATSF1O43719 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
HTATSF1O43719 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
HTATSF1O43719 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
HTATSF1O43719 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
HTATSF1O43719 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
HTATSF1O43719 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
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