Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GATCO43716 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GATCO43716 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GATCO43716 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GATCO43716 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATCO43716 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATCO43716 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATCO43716 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GATCO43716 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GATCO43716 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GATCO43716 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GATCO43716 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GATCO43716 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GATCO43716 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GATCO43716 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GATCO43716 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GATCO43716 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATCO43716 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATCO43716 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATCO43716 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATCO43716 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATCO43716 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATCO43716 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATCO43716 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATCO43716 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATCO43716 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GATCO43716 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GATCO43716 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GATCO43716 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GATCO43716 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GATCO43716 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GATCO43716 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GATCO43716 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GATCO43716 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GATCO43716 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GATCO43716 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GATCO43716 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GATCO43716 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GATCO43716 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GATCO43716 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GATCO43716 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GATCO43716 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GATCO43716 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GATCO43716 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GATCO43716 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GATCO43716 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GATCO43716 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GATCO43716 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GATCO43716 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GATCO43716 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GATCO43716 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GATCO43716 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GATCO43716 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GATCO43716 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GATCO43716 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GATCO43716 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GATCO43716 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GATCO43716 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GATCO43716 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GATCO43716 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GATCO43716 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GATCO43716 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GATCO43716 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GATCO43716 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GATCO43716 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GATCO43716 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GATCO43716 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GATCO43716 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GATCO43716 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GATCO43716 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GATCO43716 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GATCO43716 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GATCO43716 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GATCO43716 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GATCO43716 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATCO43716 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATCO43716 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATCO43716 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATCO43716 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATCO43716 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATCO43716 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATCO43716 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATCO43716 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATCO43716 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATCO43716 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATCO43716 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATCO43716 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATCO43716 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATCO43716 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATCO43716 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATCO43716 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATCO43716 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATCO43716 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATCO43716 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GATCO43716 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GATCO43716 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GATCO43716 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GATCO43716 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GATCO43716 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GATCO43716 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms