Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHMP2AO43633 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHMP2AO43633 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHMP2AO43633 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHMP2AO43633 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHMP2AO43633 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHMP2AO43633 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHMP2AO43633 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHMP2AO43633 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHMP2AO43633 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CHMP2AO43633 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHMP2AO43633 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHMP2AO43633 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHMP2AO43633 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHMP2AO43633 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP2AO43633 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP2AO43633 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP2AO43633 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP2AO43633 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP2AO43633 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP2AO43633 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP2AO43633 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP2AO43633 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP2AO43633 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP2AO43633 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP2AO43633 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP2AO43633 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP2AO43633 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP2AO43633 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP2AO43633 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP2AO43633 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP2AO43633 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP2AO43633 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP2AO43633 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP2AO43633 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP2AO43633 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP2AO43633 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP2AO43633 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP2AO43633 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP2AO43633 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP2AO43633 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP2AO43633 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP2AO43633 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP2AO43633 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP2AO43633 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP2AO43633 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMP2AO43633 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMP2AO43633 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMP2AO43633 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMP2AO43633 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMP2AO43633 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMP2AO43633 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMP2AO43633 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMP2AO43633 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMP2AO43633 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMP2AO43633 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP2AO43633 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP2AO43633 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP2AO43633 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP2AO43633 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP2AO43633 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP2AO43633 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP2AO43633 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP2AO43633 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CHMP2AO43633 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CHMP2AO43633 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHMP2AO43633 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHMP2AO43633 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHMP2AO43633 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHMP2AO43633 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CHMP2AO43633 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CHMP2AO43633 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CHMP2AO43633 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CHMP2AO43633 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CHMP2AO43633 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMP2AO43633 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMP2AO43633 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMP2AO43633 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMP2AO43633 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMP2AO43633 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMP2AO43633 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMP2AO43633 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMP2AO43633 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMP2AO43633 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMP2AO43633 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMP2AO43633 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHMP2AO43633 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHMP2AO43633 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHMP2AO43633 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHMP2AO43633 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHMP2AO43633 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHMP2AO43633 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHMP2AO43633 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHMP2AO43633 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHMP2AO43633 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP2AO43633 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP2AO43633 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP2AO43633 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP2AO43633 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP2AO43633 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms