Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC3O43617 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC3O43617 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC3O43617 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC3O43617 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC3O43617 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC3O43617 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC3O43617 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC3O43617 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC3O43617 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC3O43617 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC3O43617 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC3O43617 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC3O43617 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC3O43617 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC3O43617 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC3O43617 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC3O43617 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC3O43617 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC3O43617 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC3O43617 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC3O43617 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC3O43617 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC3O43617 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC3O43617 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC3O43617 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC3O43617 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC3O43617 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC3O43617 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC3O43617 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC3O43617 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC3O43617 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC3O43617 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC3O43617 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC3O43617 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC3O43617 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC3O43617 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC3O43617 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC3O43617 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC3O43617 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC3O43617 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC3O43617 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC3O43617 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC3O43617 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC3O43617 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC3O43617 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC3O43617 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC3O43617 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC3O43617 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC3O43617 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC3O43617 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC3O43617 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC3O43617 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC3O43617 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC3O43617 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC3O43617 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC3O43617 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC3O43617 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRAPPC3O43617 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRAPPC3O43617 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms