Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFSF14O43557 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNFSF14O43557 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFSF14O43557 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFSF14O43557 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFSF14O43557 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFSF14O43557 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFSF14O43557 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF14O43557 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF14O43557 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF14O43557 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF14O43557 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF14O43557 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFSF14O43557 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFSF14O43557 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFSF14O43557 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFSF14O43557 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFSF14O43557 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF14O43557 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF14O43557 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFSF14O43557 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFSF14O43557 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFSF14O43557 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFSF14O43557 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFSF14O43557 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFSF14O43557 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFSF14O43557 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFSF14O43557 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFSF14O43557 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFSF14O43557 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFSF14O43557 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFSF14O43557 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFSF14O43557 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFSF14O43557 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFSF14O43557 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFSF14O43557 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFSF14O43557 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFSF14O43557 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFSF14O43557 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFSF14O43557 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFSF14O43557 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFSF14O43557 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFSF14O43557 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFSF14O43557 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFSF14O43557 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFSF14O43557 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFSF14O43557 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFSF14O43557 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFSF14O43557 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFSF14O43557 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFSF14O43557 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFSF14O43557 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFSF14O43557 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFSF14O43557 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFSF14O43557 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFSF14O43557 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFSF14O43557 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFSF14O43557 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFSF14O43557 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFSF14O43557 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFSF14O43557 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFSF14O43557 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFSF14O43557 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFSF14O43557 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFSF14O43557 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFSF14O43557 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFSF14O43557 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFSF14O43557 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFSF14O43557 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFSF14O43557 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFSF14O43557 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFSF14O43557 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFSF14O43557 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFSF14O43557 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFSF14O43557 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFSF14O43557 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNFSF14O43557 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFSF14O43557 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFSF14O43557 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFSF14O43557 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFSF14O43557 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFSF14O43557 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFSF14O43557 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFSF14O43557 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFSF14O43557 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFSF14O43557 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF14O43557 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF14O43557 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF14O43557 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF14O43557 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF14O43557 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF14O43557 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF14O43557 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF14O43557 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF14O43557 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF14O43557 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF14O43557 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFSF14O43557 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFSF14O43557 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFSF14O43557 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms